Les e-commerçants doivent gérer un flux constant d’opérations : ventes, encaissements, stocks, retours, TVA, marketplaces, outils web… La comptabilité devient alors rapidement complexe. Pour rester concentré sur les ventes, s’appuyer sur un comptable en ligne e-commerce devient une réelle nécessité. À la fois réactif, connecté et rigoureux, il vous aide à piloter votre activité sereinement et en toute conformité.
Quelles obligations comptables pour les e-commerçants ?
La comptabilité e-commerce obéit aux mêmes règles que pour les autres entreprises commerciales. Il y a néanmoins quelques spécificités à ne pas négliger.
Même en micro-entreprise, certaines obligations demeurent : facturation, tenue d’un registre des achats, conservation des justificatifs. Pour les structures au régime réel, les exigences sont plus élevées : comptabilité d’engagement, suivi des créances/dettes, déclaration de TVA e-commerce, liasse fiscale e-commerce, etc.
À cela s’ajoutent les contraintes liées à la vente en ligne : multi-canal, devises étrangères, TVA intracommunautaire, places de marché. Un expert-comptable e-commerce vous permet de cadrer ces éléments et de les automatiser autant que possible.
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En quoi un comptable en ligne est-il adapté à l’activité e-commerce ?
Faire appel à un comptable en ligne pour e-commerce présente plusieurs avantages. Le fonctionnement digital est particulièrement adapté à la vente en ligne, souvent très automatisée. Vos outils de facturation, vos flux Shopify, Prestashop ou WooCommerce peuvent être connectés à un outil comptable e-commerce comme Pennylane (utilisé en interne chez Wity), pour centraliser les documents et éviter les oublis.
Votre comptable marketplace peut également vous aider à gérer les commissions, les échéances, les stocks ou encore les remboursements clients. Cela facilite la gestion comptable e-commerce, tout en vous assurant un suivi rigoureux.
Voici les outils connectés qui peuvent être reliés à votre comptabilité :
- CMS : Shopify, WooCommerce, Prestashop
- Plateformes : Amazon, Cdiscount, eBay, Etsy
- Logiciels de facturation e-commerce : Quickbooks, Axonaut, Sellsy, etc.
Tableau comparatif : comptabilité e-commerce en solo ou avec un comptable en ligne
Tâche | Sans accompagnement | Avec un comptable en ligne |
---|---|---|
Collecte des pièces justificatives | Manuel | Automatisée via Pennylane |
Traitement de la TVA intracommunautaire | Complexe | Pris en charge par votre comptable |
Rapprochement bancaire | À réaliser soi-même | Géré automatiquement |
Déclarations fiscales | À préparer et transmettre seul | Réalisées et envoyées par Wity |
Liasse fiscale e-commerce | À générer et valider | Réalisée par le comptable |
Conseils personnalisés | Non inclus | Inclus dans la prestation |

Toujours à vos côtés pour gérer votre comptabilité d’e-commerce
Chez wity, chaque entrepreneur dispose d’un collaborateur comptable en ligne, dédié. Une question ? Un besoin ? Vous ne serez plus jamais seul face à votre comptabilité !
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Quel est le tarif d’un comptable en ligne pour e-commerçant ?
Les frais comptables e-commerce dépendent de plusieurs facteurs : le volume de ventes, le statut juridique et la complexité de l’activité.
Chez Wity, nous proposons une offre adaptée à votre boutique en ligne, avec un accompagnement comptable LMNP complet à un tarif maîtrisé. Le coût moyen oscille entre 80 € et 150 € HT par mois, selon les options choisies.
Pourquoi choisir Wity comme expert-comptable e-commerce ?
Chez Wity, vous êtes donc accompagné par un expert-comptable en ligne spécialisé e-commerce, qui connaît vos contraintes et vos outils. Vous bénéficiez :
- D’un accompagnement sur-mesure dès la création de votre entreprise
- D’un accès à une interface intuitive pour déposer vos documents
- D’un interlocuteur dédié, qui vous conseille et répond rapidement
- D’une analyse de rentabilité e-commerce pour mieux piloter votre activité
Contrairement à d’autres acteurs du marché, nous ne vous vendons pas un simple logiciel de comptabilité e-commerce. Votre comptable dédié s’occupe de tout : saisie, vérification, TVA, déclarations, clôtures, bilan, liasse fiscale…

Gérer les dépenses de votre activité de E-commerce n’a jamais été aussi simple
Fini le temps où vous deviez courir après vos factures et justificatifs de paiement. Connectez facilement vos comptes fournisseurs (ex : SNCF, Uber, Orange, etc.) à votre espace en ligne. Nous récupérons directement vos factures et les attachons aux opérations bancaires correspondantes.
FAQ – Comptabilité E-commerce : les réponses à vos questions
Pourquoi choisir l'expert comptable en ligne wity quand on est en e-commerce ?
Tout d’abord, la société wity est inscrite au tableau de l’Ordre des experts-comptables et détient donc les mêmes compétences et obligations qu’un cabinet comptable traditionnel. Proposer une offre d’expertise-comptable 100% digitale nous permet de vous proposer la même qualité de service à des prix beaucoup plus compétitifs pour tous !
Comment gérer la TVA quand on vend sur Shopify ou Amazon ?
Les ventes réalisées via Shopify ou Amazon impliquent souvent des règles de TVA différentes selon la localisation des clients. Un expert-comptable e-commerce vous aide à gérer les seuils de TVA dans l’UE et à établir les déclarations correspondantes.
Un comptable en ligne est-il obligatoire pour une activité e-commerce ?
Il n’est pas obligatoire, mais fortement recommandé. La comptabilité e-commerce implique des obligations fiscales, une TVA complexe, et un volume de données important. Un expert-comptable garantit la conformité de votre gestion.
Quel statut juridique choisir pour un site e-commerce ?
Tout dépend de vos ambitions : micro-entreprise pour démarrer rapidement, SASU ou EURL pour structurer votre activité. Un comptable peut vous orienter vers la meilleure forme en fonction de vos objectifs.
Quel est le rôle du comptable avec Prestashop ou WooCommerce ?
Le comptable en ligne Prestashop ou WooCommerce analyse les données issues du CMS, récupère les factures, et les intègre à votre comptabilité. Il vous accompagne aussi dans le paramétrage initial.
Comme d’autres sites E-commerce,
choisissez l’expert comptable en ligne wity…
Un grand merci pour votre accompagnement quotidien et vos conseils précieux pour mon e-commerce ! De vrais experts !
J’avais besoin d’un cabinet d’expertise comptable pour lancer mon ecommerce. je suis très satisfait de Wity.
Merci à ma comptable Estelle, qui a su m’aider pour transformer mon activité. Merci aussi à l’équipe relation clients pour votre accompagnement.